Salah satu upaya pemerintah mengurangi learning loss pada peserta didik akibat pandemi Covid-19 adalah dengan melakukan pembelajaran tatap muka terbatas (PTMT). Tentu saja pelaksanaaan PTMT dilakukan berdasarkan SKB 4 menteri dan memenuhi daftar periksa. PTMT boleh dilakukan bagi daerah zona aman pemaparan Covid-19 serta guru sudah melakukan vaksinasi.
Pemerintah sangat fokus dengan ini. Apalagi saat penyebaran virus Covid-19 semakin massif dan mudah menyerang anak-anak. Hak anak tetap harus diberikan. Namun tetap mengutamakan kesehatan dan keselamatan anak. Oleh karena itu, pemberian vaksin tidak hanya diberlakukan untuk tenaga pengajar, namun juga harus diberikan bagi peserta didik.
Pada tanggal 6 Oktober 2021 ini MTsN 9 Magetan melaksanakan kegiatan Vaksinasi Covid-19 untuk peserta didik yang berlokasi di MAN 1 Magetan. Kegiatan tersebut diikuti oleh 240 peserta didik yang sudah berusia 12 tahun keatas. Selain dari MTsN 9 Magetan kegiatan vaksinasi tersebut juga diikuti oleh peserta didik dari Madrasah lain, yaitu MTsN 3 Magetan, MTsN 4 Magetan, MTsN 6 Magetan dan MTsN 7 Magetan. Total peserta dari seluruh madrasah kurang lebih ada 2000 peserta didik yang sudah mendapatkan vaksin covid-19 dosis pertama.